Parmi ces grandes catégories, il existe également des sous-catégories : School-life, Action, Aventure, Combat, Drame, Mystère, etc.
Malgré ce que l'on pourrait penser, les catégories ne sont pas limités en sous-catégories. En effet, un manga plutôt destiné pour les jeunes filles (environ 12-16 ans) peut très bien contenir de l'action ou du combat et également prendre les codes d'un mangas pour jeunes garçon tout en restant ciblé pour les jeunes filles. Pour prendre l'exemple le plus populaire : Sailor Moon, un shojo parlant d'Usagi, jeune fille devenant Sailor Moon une guerrière des étoiles. Elle va alors se battre aux côtés de ses amis pour défendre la Terre.